vimrcに以下を記述しておけば、Vim起動時に未インストールのbundleがないかどうかをチェックして、あればインストールを促すプロンプトを表示してくれます。
プロンプトの表示に従いyesを押せば、そのままNeoBundleInstallが実行されます。
NeoBundleCheck
ですので、vimrcにNeoBundleを追加して保存した後、
:source $HOME/_vimrc
としてvimrcを再読み込みしてあげれば(上記はWindows環境を想定してます)、Vim起動時同様にチェックが走ります。
下記のREADMEに書いていますが、NeoBundleのことを調べていても意外にNeoBundleCheckのことを載せている記事が少なかったのでメモしておきます。
https://github.com/Shougo/neobundle.vim