vim --startuptime startup.log file_to_open
で計測結果が startup.logに書き込まれます。
最初よくわからず vim --startuptime file_to_openとやって、開きたいファイルにログを書き込んでしまっていました。
今回は Markdown を開くときに異様に遅く、計測してみると vim-css-colorで何秒もかかっていました。どうも Markdown の見出しの #をカラーコードと勘違いしていたみたいです。
vim-css-colorは遅いし関係ないファイルでも動作してしまうので、後発の vim-coloresqueに換えたら速くなりました。めでたしめでたし。